1、建立条件不同
学籍：按照国家招生规定录取的新生，持录取通知书，到校办理入学手续，复查合格者予以注册，取得学籍。
考籍：指参加甘肃自考的考生，在取得一门以上(含一门)山东自考课程合格后，省考试院为其建立考籍档案。
2、考籍无法被开除，学籍可以
如果普通在校生违反学校规定，学校有权开除该生的学籍，一旦开除学籍，将不能继续在校学习，其后发生的一切均与学校无关。
甘肃自学考试考生一旦取得考籍，它是无法开除或注消的，即使考试挂科或作弊，也不能开除或注销考籍，但是要对舞弊行为作出相应的处罚。
3、考籍可转出，学籍不行
学籍是不能随便转移的，学籍管理部门主要是高校;
甘肃自考考生的考籍是省招办主要以电子方式储存管理的，转考分省内和省际转考。
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