自考和函授本科区别在于考试含金量不同、招生对象不同、学习方式不同、学习年限不同、文凭不同。
一、考试含金量区别
虽然成考和自考的本科证书都是国家承认的学历，但是在社会上的认可度，自考认可度更高。
成考函授本科入学，严进宽出。但自考出来的证书，是除统招之外含金量最高的学历。通过率低、宽进严出的筛选方式，一定程度上保证了考生本身踏实、勤学的优势。

二、招生对象区别
除个别省份要求报考自考本科必须出示专科毕业证书之外，大多数省份都可以直接报名自考本科，也就是说，还没取得专科学历的同学，可以同时进行专科和本科的考试，只需要在本科申请毕业时，出示专科学历即可。
函授本科，报考高起专、本科的考生必须具有高中毕业文化程度;报考专升本的考生必须是具有教育部审定核准的国民教育系列高等学校、高等教育自学考试机构颁发的专科毕业证书或以上证书的人员。

三、学习方式区别
函授与自考多数都是自学，但也有一定的差异。函授是成人高考的一种学习方式，需要通过成人高考被录取后才可以。每学年安排3次左右为期10天或半个月的集中面授。
而自考是通过自学学习大学课程，无需参加入学考试。

四、学习年限区别
自考本科，如果考试顺利的话，能在一年半左右结业发学历证书。函授本科是最少要两年半才能毕业，函授本科相对来讲时间要长一点。

五、文凭区别
成考的文凭是各大学的成教学院发的，你考上了哪个大学的成教，毕业时就会盖有哪个大学的章。
自考的文凭上盖有两个章，一个是主考院校的章，另一个是当地自考委的章。自考本科与函授本科达到条件者国家均可授予学士学位。