南京审计大学继续教育学院负责南京审计大学成人高等教育、自学考试和各类人员在职培训等。南京审计大学继续教育学院与南京审计大学管理干部学院两院合一，实行两块牌子、一套班子的运行模式。

        南京审计大学继续教育学院内设有综合办公室、成人教育部、自学考试部、培训中心四个管理部门。 南京审计大学成人高等教育开办函授、业余两种学习形式，开设有审计学、会计学、金融学、保险、投资学、国际经济与贸易、计算机信息管理、工商管理、财务管理、人力资源管理、电子商务、法学、英语等专、本科专业。