继续教育学院负责统筹、协调、组织和管理全校继续教育工作，履行统筹、管理、监督、指导、服务的职责，同时，又是校直属函授站，兼有管理职能和办学职能，是学校服务社会的重要窗口。管理范围包括全校的成人学历教育和非学历教育；办学形式主要有成人函授、业余、自考、培训等。设有四个办公室：学院办公室、教学管理科、招生办公室和自考与培训办公室。
学院前身为 1978年成立的南京气象学院函授短训部， 1981年更名为进修部， 1990年更名为成人教育中心， 1999年成立成人教育学院， 2011年更名为继续教育学院。随着学校的快速发展，继续教育的办学规模也逐年扩大，办学层次逐步提高，办学形式逐渐多样化。
