继续教育学院是该校负责统筹、协调、组织和管理全校继续教育工作的机构，代表学校与校外单位洽谈或签署开办继续教育的协议，兼有管理职能和办学职能。其办学宗旨：立足民航、服务民航、面向社会。其任务是：根据民航和社会发展需要，开展多层次的学历教育和在职人员的专业技能培训。继续教育学院设六个职能科室：办公室、教务管理办公室、培训部、招生与市场拓展办公室、网络教育部和学生管理与质量评价办公室。
继续教育学院自1993年建院以来不断充实办学条件，创新办学机制，拓宽办学渠道，开展了多层次的学历教育和岗位培训。目前，学院共有在籍学生5000余人（含自考考生），开设了一系列适合民航需要的特色专业。继续教育学院现在全国设有北京、深圳、昆明、厦门、长沙、镇江函授辅导站以及三亚高等教育自学考试助学点。学历教育的办学层次分为：高中起点专科、高中起点本科、专科起点本科和在职工程硕士。在职工程硕士的招生领域为：航空工程、交通运输工程、电子与通信工程、控制工程和计算机技术。学院培训领域覆盖了空管、机务、航空安全、交通运输、适航、机场等专业，较好地满足了民航企事业单位工作人员的知识更新、岗位适应、能力提升及情操陶冶的学习需求，实现了继续教育的跨越式发展，为全国民航培训了大量急需紧缺的高素质人才。
2015年底学校对全校继续教育管理体制进行改革，将继续教育管理处与继续教育学院合并成立新的继续教育学院，并将原分散在各二级学院的在职教学资源统一归口到继续教育学院，由继续教育学院统一组织和管理全校在职人员学历教育和培训工作。继续教育学院坚持“高层次、高质量、高效益、国际化”的继续教育办学基本方针，加强理论研究，探索继续教育办学规律，充分发挥学校民航学科的综合性优势，合理协调与配置学校内部以及民航系统的各类教学资源，努力满足民航事业发展对人才的需要，为全面构建我国民航终身教育体系和落实民航强国战略做出更大的贡献！
